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利用深度学习准确预测导管内乳头状黏液性肿瘤的组织学分级 2026-08-21


本期推荐 & 解读  BY 单飞 | 南昌大学

↓ 消化病学专题丨88

Endoscopy

Accurate prediction of histological grading of intraductal papillary mucinous neoplasia using deep learning

Schulz Dominik et al.

中文内容仅供参考,以英文原文为准,欢迎识别二维码阅读。

背景

导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的风险分层和手术建议目前是基于共识指南。由于细针穿刺的低敏感性,术前组织学的风险分层只是潜在的决定性因素。在本研究中,我们开发并验证了一种基于深度学习的方法,利用内镜超声(EUS)图像来区分低级别异常增生的IPMN和高级别异常增生/浸润性癌的IPMN。

胰腺囊肿带来了一个难题。一方面,胰腺囊肿是一个常见病,在一项前瞻性研究中,发病率几乎达到50%。另一方面,导管内乳头状粘液瘤(IPMNs)等亚型可以进展为胰腺癌,胰腺癌仍然是所有癌症中存活率最差的癌症之一,在过去20年中没有出现大幅下降。为了防止过度治疗而不遗漏令人担忧的病变,基于证据的风险评估是强制性的。在大多数其他癌症和癌前病变中,风险评估是基于术前组织学的。然而,对于IPMNs,目前还没有方法可以在术前以足够高的准确性预测组织学。超声内镜(EUS)引导下细针穿刺(FNA)的荟萃分析显示,其敏感性低,为68.4%。

方法

进行模型训练,我们从2015年3月至2021年8月43例胰切除术患者中获得了3355张EUS图像。所有患者均经组织学证实为IPMN。我们使用迁移学习来微调卷积神经网络,并将“低级别IPMN”从“高级别IPMN/浸润性癌”进行分类。我们的测试集包括来自27例患者的1823张图像,回顾性招募了11例患者,7例前瞻性患者,9例外部患者。我们将我们的结果与基于国际共识指南的预测进行了比较。

我们检索了 IPMN 的病理报告,发现在2015年3月至2021年8月期间,共有149名患者在本诊所接受了胰腺切除术。胰腺切除术是经我们的跨学科肿瘤委员会会议讨论后推荐的。推荐依据是现有的国际和国内指南,其中大部分遵循欧洲指南。在本研究中,有66例患者因IPMN只是继发于导管癌或其他类型的胰腺癌而被排除在外(图 1)。另有29名患者因术前无EUS记录而被排除在外。剩下的54名患者根据病理报告分为高级别/浸润性癌和低级别IPMN。随机选取了43名患者进行人工神经网络训练。

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图1. 将患者的选择和分离划分为测试和训练数据。MUK慕尼黑国立医学医学大学;IPMN,导管内乳头状黏液性肿瘤;EUS,内镜超声;FR,弗莱堡大学。

为图像分类任务开发了一个卷积神经网络(CNN)。对于预处理,图像被调整大小,像素值被归一化。为了防止过度拟合,使用了各种数据增强技术,如旋转、翻转、扭曲、亮度变化和剪切混合。对于主要深度学习模型,尝试了多种方法,如从头开始训练CNN或迁移学习。我们最终也是最成功的模型是基于一种迁移学习方法,使用效率网B5主干和相应的ImageNet上的预训练权重。在训练过程中,使用Adam优化器和交叉熵损失函数来调整权重。在fastAI 中实现了对最后一个特征层的微调。该代码运行在NVIDIA特斯拉K80或T4上运行。结果在0到0.5和0.5到1之间的结果用于每个图像的最终二值分类。

结果

我们的方法可以将低分级和高分级/浸润性癌进行分类,准确率为99.6%(95%CI 99.5%-99.9%)。与任何个别指南相比,我们的深度学习模型在预测组织学结果方面取得了更高的准确性,其准确性在51.8%(95%CI31.9%-71.3%)和70.4%(95%CI49.8-86.2)之间。

表1显示了患者的特征。在纳入的54例患者中,23例经组织学证实为低级别IPMN。其余31名患者至少患有高级别IPMN或早期浸润癌。在高级别/浸润性癌组中,MD-IPMN的比例较高,BD-IPMN的比例较低(48.4% 对 30.4%,12.9% 对 26.1%)。两组混合型IPMN的发病率相当(高级别/浸润性癌为 38.7%,低级别为 43.5%)。我们发现组织学亚型的分布情况相当,低级别组中胃癌的发病率略高(43.5% 对 35.5)。

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表1. 患者特征。

在来自27名患者的总共1823张测试图像中,我们的机器学习方法将656张图像正确分类为高级别/浸润性癌,1164张正确分类为低级别IPMN(图2)。来自低级别组的三张图像未正确分类为低级别。总体准确率为99.6%,敏感性为100%,特异性为99.7%(表2)。

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图2. 混淆矩阵显示,所有656例高级别导管内乳头状黏液瘤(IPMN)/浸润性癌(HG/IC)和1164例低级别IPMN(LG)图像均被正确分类。

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表2. 基于指南的组织学分级预测与我们的深度学习方法之间的比较。

图3显示了来自测试集中的12名患者的总共12张图像。通过我们的深度学习模型,对所有的图像都进行了正确的分类。上面的两行显示了6例低级别IPMNs,下面的两行显示了高级别IPMNs/浸润性癌。特别是,来自第二行的低级别IPMN在视觉上似乎很难与最后一行的高级别IPMN/浸润性癌区分开来;然而,模型可以正确地对它们进行分类。

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图3. 测试集中12例患者共12张图像。前6张图像被正确预测为低级别导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN),后6张图像被正确预测为高级别IPMN/浸润性癌。

结论

这项试验性研究表明,IPMN-EUS 图像中的深度学习可高精度预测组织学结果。

讨论

这项研究开发并验证了一种基于深度学习的方法,利用内镜超声(EUS)图像准确预测胰管内乳头状粘液性肿瘤(IPMN)的组织学分级。作者使用43名接受胰腺切除术的患者的3355张EUS图像训练了一个卷积神经网络模型,然后在27名额外患者的1823张图像上测试了该模型。该深度学习模型在区分低级IPMN和高级IPMN/浸润性癌方面的准确率达到99.6%,优于现有临床指南的51.8%至70.4%的准确率。这项初步研究展示了深度学习在改善IPMN患者的风险分层和治疗决策方面的潜力。

关键点

  • 开发了一种基于深度学习的方法,利用内镜超声(EUS)图像准确预测胰管内乳头状粘液性肿瘤(IPMNs)的组织学分级。

  • 在来自43名患者的3,355张EUS图像上训练了一个卷积神经网络,并在来自27名额外患者的1823张图像上进行了测试。

  • 该深度学习模型在区分低级别IPMNs和高级别IPMNs/浸润性癌方面达到了99.6%的准确率。

  • 优于现有临床指南的准确性,其范围从51.8%到70.4%。

  • 展示了深度学习在改善IPMNs患者的风险分层和指导治疗决策方面的潜力。

END

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